Single cell profiling of circulating autoreactive CD4 T cells from patients with autoimmune liver diseases suggests tissue imprinting
Anaïs Cardon
(1)
,
Thomas Guinebretière
(1)
,
Chuang Dong
(2)
,
Laurine Gil
(2)
,
Sakina Ado
(2)
,
Pierre-Jean Gavlovsky
(1)
,
Martin Braud
(1)
,
Richard Danger
(1)
,
Christoph Schultheiß
(3)
,
Aurélie Doméné
(4, 5)
,
Perrine Paul-Gilloteaux
(5, 4)
,
Caroline Chevalier
(6, 4)
,
Laura Bernier
(1)
,
Jean-Paul Judor
(1)
,
Cynthia Fourgeux
(1)
,
Astrid Imbert
(4)
,
Marion Khaldi
(4)
,
Edouard Bardou-Jacquet
(7, 8)
,
Laure Elkrief
(9)
,
Adrien Lannes
(10, 11)
,
Christine Silvain
(12)
,
Matthieu Schnee
(13)
,
Florence Tanne
(14)
,
Fabienne Vavasseur
(6)
,
Lucas Brusselle
(1)
,
Sophie Brouard
(1)
,
William W Kwok
(15)
,
Jean François Mosnier
(4)
,
Ansgar Lohse
(16)
,
Jeremie Poschmann
(1)
,
Mascha Binder
(3)
,
Jérôme Gournay
(1, 17)
,
Sophie Conchon
(1)
,
Pierre Milpied
(2)
,
Amédée Renand
(1, 4)
1
U1064 Inserm - CR2TI -
Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology
2 CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy
3 University Hospital Basel [Basel]
4 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
5 BioCore [Nantes]
6 CIC 0004 - Nantes - Centre d'investigation clinique (CIC) de Nantes -CIC Plurithématique
7 Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]
8 NuMeCan - Nutrition, Métabolismes et Cancer
9 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
10 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
11 HIFIH - Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques
12 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
13 CHD Vendée - Centre Hospitalier Départemental - Hôpital de La Roche-sur-Yon
14 CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest
15 BRI - Benaroya Research Institute [Seattle]
16 UKE - Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg]
17 Institut des Maladies de l'Appareil Digestif
2 CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy
3 University Hospital Basel [Basel]
4 CHU Nantes - Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital
5 BioCore [Nantes]
6 CIC 0004 - Nantes - Centre d'investigation clinique (CIC) de Nantes -CIC Plurithématique
7 Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]
8 NuMeCan - Nutrition, Métabolismes et Cancer
9 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
10 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
11 HIFIH - Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques
12 CHU de Poitiers [La Milétrie] - Centre hospitalier universitaire de Poitiers = Poitiers University Hospital
13 CHD Vendée - Centre Hospitalier Départemental - Hôpital de La Roche-sur-Yon
14 CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest
15 BRI - Benaroya Research Institute [Seattle]
16 UKE - Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg]
17 Institut des Maladies de l'Appareil Digestif
Anaïs Cardon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1270014
- ORCID : 0000-0003-4650-6632
- IdRef : 263700224
Chuang Dong
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501399
- ORCID : 0000-0002-8685-1070
Pierre-Jean Gavlovsky
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501400
- ORCID : 0000-0001-5736-5711
Richard Danger
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767374
- ORCID : 0000-0002-5058-795X
- IdRef : 158591453
Christoph Schultheiß
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501401
- ORCID : 0000-0001-9789-5776
Aurélie Doméné
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1168886
- ORCID : 0000-0002-4328-6526
Perrine Paul-Gilloteaux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 176916
- IdHAL : perrine-paul-gilloteaux
- ORCID : 0000-0002-4822-165X
- IdRef : 236865714
Caroline Chevalier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501402
- ORCID : 0000-0002-5210-2020
Jean-Paul Judor
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1430276
- ORCID : 0000-0002-0340-7821
Cynthia Fourgeux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767382
- ORCID : 0000-0002-3330-7530
Edouard Bardou-Jacquet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1029838
- ORCID : 0000-0002-0784-0710
Laure Elkrief
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1197475
- ORCID : 0000-0003-2843-1710
Christine Silvain
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762366
- ORCID : 0000-0002-0712-8491
Matthieu Schnee
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501403
- ORCID : 0000-0001-6152-405X
Fabienne Vavasseur
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1375743
- ORCID : 0000-0002-0531-4354
Lucas Brusselle
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1421130
Sophie Brouard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 975730
- ORCID : 0000-0002-6398-1315
- IdRef : 073751480
William W Kwok
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501404
- ORCID : 0000-0003-4843-4599
Jean François Mosnier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1430035
- ORCID : 0000-0003-2637-3641
Ansgar Lohse
- Fonction : Auteur
- PersonId : 783656
- ORCID : 0000-0002-8823-3129
Jeremie Poschmann
- Fonction : Auteur
- PersonId : 808208
- ORCID : 0000-0002-9613-5297
- IdRef : 265878187
Mascha Binder
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1501405
- ORCID : 0000-0003-0663-3004
Sophie Conchon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1048486
- ORCID : 0000-0003-2602-3385
- IdRef : 058648909
Pierre Milpied
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1192491
- ORCID : 0000-0003-1873-5358
Résumé
Autoimmune liver diseases (AILD) involve dysregulated CD4 T cell responses against liver self-antigens, but how these autoreactive T cells relate to liver tissue pathology remains unclear. Here we perform single-cell transcriptomic and T cell receptor analyses of circulating, self-antigen-specific CD4 T cells from patients with AILD and identify a subset of liver-autoreactive CD4 T cells with a distinct B-helper transcriptional profile characterized by PD-1, TIGIT and HLA-DR expression. These cells share clonal relationships with expanded intrahepatic T cells and exhibit transcriptional signatures overlapping with tissue-resident T cells in chronically inflamed environments. Using a mouse model, we demonstrate that, following antigen recognition in the liver, CD4 T cells acquire an exhausted phenotype, play a crucial role in liver damage, and are controlled by immune checkpoint pathways. Our findings thus suggest that circulating autoreactive CD4 T cells in AILD are imprinted by chronic antigen exposure to promote liver inflammation, thereby serving as a potential target for developing biomarkers and therapies for AILD.
Domaines
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